第一种模式：固定总价合同

这种模式下，开发商将依据项目需求提供一个总费用报价，并在签订合同时确定这一金额不会更改。这种方式适合于已经明确所有细节的项目，因为一旦价格敲定，任何额外修改都将需要双方协商。

第二种模式：分阶段支付合同

另一种选择是基于项目的阶段性进展进行付款。这种方式允许在开发过程中根据完成度逐步支付费用，这对于长期或复杂项目尤其有优势，因为这可以确保双方都对项目的进度和质量保持透明。

固定总价合同：成本控制好；风险由乙方承担。
分阶段支付合同：灵活性高；合作更紧密。

在实际操作中，我们建议采用第二种模式。虽然初期可能需要投入更多的时间进行详细的项目规划，但从长远来看，这能够有效降低因需求变更导致的成本增加风险，并且有利于保持双方的良好沟通和信任关系。

总之，在制定教育软件开发协议书时，请确保详细列出各方的责任、权利以及合作期限等关键信息。希望上述对比分析能为你的决策提供有益的参考！